東北大学大学院医学系研究科・医学部

STAFF

Professor

• Ogishima, SoichiProfessor. 荻島 創一 教授
  

Other Faculty / Staff

• Nagaie, Satoshi

  Lect. 永家 聖 講師

• Mizuno, Satoshi

  Assistant Prof. 水野 聖士 助教

• Ishiwata, Ryosuke

  Assistant Prof. 石渡 龍輔 助教

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OUTLINE

Our laboratory is engaged in the research of informatics for genomic medicine. To clarify the mechanisms of disease onset and progression taking into account both the background of individual genetic factors and the influence of environmental factors, we have integrated genome, multi-omics, and medical data and using informatics approaches such as large-scale data analysis and machine learning. In the case of multifactorial diseases, it is necessary to conduct disease research as a transition of the disease state, taking comorbidity into account. Therefore, we aim to establish a new disease concept based on molecular pathological and deep phenotype transitions that take comorbidity into account.

当研究室では、ゲノム医療のための情報学の研究に取り組んでいます。個人ごとの遺伝要因を背景として、環境要因の影響を考慮して、疾患の発症と進行の機序を明らかにするため、　大規模なゲノム・オミックス情報、医療情報等のデータを統合し、大規模データ解析や機械学習等の情報学のアプローチでの解明に取り組んでいます。多因子疾患においては、併存症（comorbidity）も考慮した病態の遷移として疾患研究を行う必要があります。そこで、併存症などを考慮した内在的な分子病態の遷移による新たな疾患概念の確立を目指しています。

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  Elucidation of new disease concepts by molecular pathology and phenotype in genomic medicine
  ゲノム医療における分子病態と表現型による新たな疾患概念の解明

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  Lab members
  研究室メンバー

ARTICLE

K hler S, et al. The Human Phenotype Ontology in 2017. Nucleic Acids Res. 45(D1):D865-D876, 2017.

Kuriyama S, et al. The Tohoku Medical Megabank Project: Design and Mission. J Epidemiol. 26(9):493-511, 2016.

Tanaka H, Ogishima S. Network biology approach to epithelial-mesenchymal transition in cancer metastasis: three stage theory. J Mol Cell Biol. 7(3):253-66, 2015.

FANTOM Consortium, et al. A promoter-level mammalian expression atlas. Nature. 507(7493):462-70, 2014.

Ogishima S, et al. A map of Alzheimer\'s disease-signaling pathways: a hope for drug target discovery. Clin Pharmacol Ther. 93(5):399-401, 2013.