東北大学大学院医学系研究科・医学部

STAFF

Professor

• Yasuda, JunProfessor. 安田 純 教授
  

CONTACT

OUTLINE

Cancer is a disease characterized by genomic alterations in somatic cells. Accumulation of various driver mutations causes malignant transformation of the cells. Our mission is to understand the molecular mechanisms of carcinogenesis while seeking for the clinical applications of cancer specific somatic genomic alteration using next generation sequencing. The main basic research projects for understanding the process of carcinogenesis are on chromosomal segregations in mitosis and DNA repair deficiencies found in clinical cancer specimen. In terms of chromosomal segregation issue, we focus on an enzyme called separase that triggers chromosome segregation. Deregulation of this enzyme in mitosis results in chromosome missegregation which is one of the major causes of genomic instability. Investigation of DNA repair deficiencies is focused on the mutational signatures in cancer cells that reflects molecular mechanisms in mutagenesis.
An example of clinical applications is the development of liquid biopsy of the cell-free DNA in plasma to detect cancer-specific driver mutations. Our laboratory extensively collaborates with clinicians at the Miyagi Cancer Center Hospital to investigate the clinically oriented questions such as identification of responsible variants in familial cancers or detection of relapses of surgically eradicated tumors. We are also contributing the clinical decision making at the bed side in interpretation of pathogenicity of the variants detected in the comprehensive genome profiling.

がんは、体細胞のゲノムの変異によって発症する疾患である。様々な遺伝子変異が蓄積されることにより、細胞の悪性化が惹起される。我々の研究室は2つの研究課題がある。一つ目が発がんの分子機構の解明であり、二つ目がNGSを用いたがん特異的ゲノム変異の網羅的検出技術の臨床応用である。一本目の柱である、基礎的な研究課題は有糸分裂における染色体分離と、臨床がん検体において観察されるDNA修復不全に関するものである。染色体分離の問題では、染色体分離の引き金となるセパラーゼと呼ばれる酵素に着目している。有糸分裂時にこの酵素の働きが阻害されると、染色体の分離不全が発生し、ゲノム不安定性の原因の１つとなることが知られている。 一方、臨床検体でのDNA修復異常の研究は、突然変異誘発の分子メカニズムを反映するがん細胞におけるMutation Signature解析などに焦点をあてている。二本目の柱である臨床応用については、宮城県立がんセンター病院の臨床医と幅広く連携し、家族性がんの原因変異の同定、がんの再発のリキッドバイオプシーでの検出、包括的ゲノムプロファイリングデータの解釈など、臨床に直結した研究を行っている。

• 

  Summary of identification of mutation that causes Carney Complex
  カーニー複合責任変異の同定のサマリー

• 

  Medium changes for culture cells
  培養細胞の培地交換

• 

  Preparation of NGS analysis for plasma cell free DNA
  血漿遊離DNAのNGS解析

ARTICLE

Ito, S. et al. A novel 8.57-kb deletion of the upstream region of /PRKAR1A/ in a family with Carney complex. Mol Genet Genomic Med 10, e1884, doi:10.1002/mgg3.1884 (2022).

Tokunaga, H. et al. Novel candidates of pathogenic variants of the /BRCA1/ and /BRCA2/ genes from a dataset of 3,552 Japanese whole genomes (3.5KJPNv2). PLoS One 16, e0236907, doi:10.1371/journal.pone.0236907 (2021).

Shindo, N. et al, Prolonged mitosis causes separase deregulation and chromosome nondisjunction. Cell Rep 34, 108652, doi:10.1016/j.celrep.2020.108652 (2021).

Minato, T. et al. Liquid biopsy with droplet digital PCR targeted to specific mutations in plasma cell-free tumor DNA can detect ovarian cancer recurrence earlier than CA125. Gynecol Oncol Rep 38, 100847, doi:10.1016/j.gore.2021.100847 (2021).

Ito, S. et al. Robustness of a Cancer Profiling Test Using Formalin-fixed Paraffin Embedded Tumor Specimens. Anticancer Res 41, 1341-1348, doi:10.21873/anticanres.14891 (2021).